Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apoa4P06728 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Apoa4P06728 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms