Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P06336 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P06336 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06336 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06336 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06336 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06336 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06336 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P06336 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06336 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P06336 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P06336 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P06336 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P06336 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms