Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06330 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06330 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06330 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06330 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06330 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06330 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06330 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P06330 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P06330 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06330 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06330 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06330 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P06330 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P06330 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06330 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06330 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06330 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P06330 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P06330 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P06330 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P06330 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P06330 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms