Protein–RNA interactions for Protein: P02525

Cryba1, Beta-crystallin A1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cryba1P02525 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cryba1P02525 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cryba1P02525 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms