Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01800 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01800 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01800 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01800 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01800 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01800 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01800 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01800 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01800 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01800 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01800 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01800 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01800 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01800 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01800 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01800 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01800 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01800 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01800 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01800 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms