Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01649 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01649 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01649 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01649 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01649 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01649 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms