Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lancl1O89112 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lancl1O89112 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms