Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Casp8O89110 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp8O89110 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp8O89110 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms