Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp1O89090 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sp1O89090 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms