Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CcnkO88874 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CcnkO88874 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CcnkO88874 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms