Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hcn3O88705 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms