Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops3O88543 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cops3O88543 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms