Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntsr1O88319 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ntsr1O88319 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ntsr1O88319 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntsr1O88319 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntsr1O88319 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntsr1O88319 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ntsr1O88319 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms