Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CaskO70589 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CaskO70589 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CaskO70589 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms