Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gfi1bO70237 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gfi1bO70237 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gfi1bO70237 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gfi1bO70237 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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