Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nipsnap1O55125 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms