Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pole2O54956 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms