Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema6bO54951 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema6bO54951 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms