Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TsksO54887 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TsksO54887 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TsksO54887 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TsksO54887 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TsksO54887 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TsksO54887 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TsksO54887 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TsksO54887 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TsksO54887 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TsksO54887 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TsksO54887 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TsksO54887 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TsksO54887 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TsksO54887 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TsksO54887 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TsksO54887 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TsksO54887 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TsksO54887 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TsksO54887 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TsksO54887 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TsksO54887 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms