Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DffbO54788 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DffbO54788 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DffbO54788 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DffbO54788 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DffbO54788 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DffbO54788 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DffbO54788 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DffbO54788 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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