Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CrxO54751 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CrxO54751 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CrxO54751 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CrxO54751 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CrxO54751 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CrxO54751 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CrxO54751 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CrxO54751 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CrxO54751 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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CrxO54751 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CrxO54751 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CrxO54751 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CrxO54751 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CrxO54751 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxO54751 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxO54751 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxO54751 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CrxO54751 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxO54751 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxO54751 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxO54751 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CrxO54751 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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