Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EdaO54693 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EdaO54693 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EdaO54693 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EdaO54693 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
EdaO54693 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EdaO54693 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EdaO54693 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EdaO54693 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EdaO54693 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EdaO54693 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EdaO54693 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms