Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccr6O54689 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Ccr6O54689 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccr6O54689 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccr6O54689 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccr6O54689 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccr6O54689 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccr6O54689 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccr6O54689 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccr6O54689 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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