Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab33bO35963 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rab33bO35963 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rab33bO35963 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Rab33bO35963 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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