Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms