Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnnO35691 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnnO35691 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnnO35691 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnnO35691 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PnnO35691 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PnnO35691 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PnnO35691 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PnnO35691 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PnnO35691 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PnnO35691 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PnnO35691 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PnnO35691 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PnnO35691 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms