Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-ObO35424 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-ObO35424 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms