Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc1O35379 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms