Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KeraO35367 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KeraO35367 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KeraO35367 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KeraO35367 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KeraO35367 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KeraO35367 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KeraO35367 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KeraO35367 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KeraO35367 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KeraO35367 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KeraO35367 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KeraO35367 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KeraO35367 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KeraO35367 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KeraO35367 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KeraO35367 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KeraO35367 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KeraO35367 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KeraO35367 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KeraO35367 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KeraO35367 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KeraO35367 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KeraO35367 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KeraO35367 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KeraO35367 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KeraO35367 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KeraO35367 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KeraO35367 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KeraO35367 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KeraO35367 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms