Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dgcr6O35347 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms