Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptpn9O35239 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptpn9O35239 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms