Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smad6O35182 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad6O35182 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms