Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif3cO35066 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif3cO35066 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms