Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CckarO08786 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CckarO08786 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CckarO08786 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CckarO08786 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CckarO08786 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CckarO08786 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CckarO08786 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CckarO08786 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CckarO08786 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms