Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Efna5O08543 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efna5O08543 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna5O08543 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna5O08543 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efna5O08543 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms