Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsmbO08540 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsmbO08540 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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