Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2056J3QQ02 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2056J3QQ02 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms