Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm5849J3QPE5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm5849J3QPE5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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