Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm5294J3QP53 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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