Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm19965J3QNY8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms