Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm20828J3KMI7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20828J3KMI7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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