Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r39G3UWE6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms