Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Srp72F8VQC1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms