Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ercc6F8VPZ5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ercc6F8VPZ5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms