Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gm28038F7BCN9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Gm28038F7BCN9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Gm28038F7BCN9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28038F7BCN9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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