Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm28048F7BCN0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm28048F7BCN0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms