Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gm20538F6Z9R1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms