Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm28305F6U473 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28305F6U473 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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