Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm340F6RGI3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm340F6RGI3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms