Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Erich3F6QRE9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Erich3F6QRE9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms